行业动态

公司新闻 技术资源 行业动态
技术分享:基因治疗小鼠常染色体隐性耳聋模型
发布时间: 2022-05-24 浏览量:

基因治疗是指通过修复致病基因,或者导入正确基因而达到治疗效果的手段。通常分为两大类:ex vivo和in vivo。Ex vivo指在体外完成细胞遗传操作修复,再将修复后的细胞输入到人体;而in vivo指将递送载体输入到人体,在体内完成细胞修复。罕见病通常为单基因病,是最适合使用基因治疗攻克的疾病。相比于其他药物,基因治疗的优势在于从源头上解决问题,理论上通过一次或数次治疗即可攻克疾病。其中AAV递送系统是现今基因治疗所采用的主流载体。


耳聋是威胁人类健康最常见的疾病之一。在遗传性耳聋中,非综合征性耳聋占比70%,其中约80%是由基因突变引起[1]。现已有124个非综合征性耳聋相关基因被发现,其中78个基因表现为常染色体隐性遗传(https://hereditaryhearingloss.org)。基因治疗为遗传性耳聋的治疗带来曙光,已有多种不同策略被报道用于治疗遗传性耳聋的小鼠模型。本文将从中选取两篇进行介绍,主要讨论采用不同基因编辑器来基因治疗小鼠常染色体隐性耳聋模型。

2020年6月,Science Translational Medicine上报道了David Liu实验室利用胞嘧啶碱基编辑器(CBE)在体内修复Tmc1功能失活突变c.A545G(p.Y182C)造成的常染色体隐性耳聋小鼠,恢复部分小鼠听力[2]。研究者将碱基编辑效率最高的CBE拆成两个部分分别装载在两个Anc80L65 AAVs中,双AAVs递送系统利用split-intein介导可在体内恢复CBE的活性。经检测发现,双AAVs递送系统体外细胞测试正确编辑效率高达57%,并且几乎没有脱靶(图一A)。在出生1天的Tmc1 c.A545G纯合突变小鼠的内耳中注射双AAVs,尽管耳蜗毛细胞占比低于2%,但是14天后可检测到整个耳蜗的基因组DNA成功编辑效率为2.3 ± 0.4%;同时,检测Tmc1 mRNA有10%-51%的Tmc1 c.A545G修复成Tmc1 c.A545A(图一B)。从扫描电镜图片可以看出,Tmc1 c.A545G纯合突变小鼠的内毛细胞(IHCs)和外毛细胞(OHCs)在4周龄开始死亡,从而出现深度耳聋(图一D)。基因治疗后4周龄小鼠的毛细胞形态与野生型相比保持正常(图一C和E)。
技术分享:基因治疗小鼠常染色体隐性耳聋模型(图1)
图一 双AAVs递送CBE的隐性耳聋小鼠基因治疗效果[2]

2022年2月,Cell Research报道了基于CRISPR/Cas9介导的优化型同源修复策略在体内修复Klhl18lowf纯合小鼠的常染色体隐性耳聋模型,恢复部分小鼠听力[3]。Klhl18基因的p.V55F错义点突变(Chr9:110455454 C>A),会导致IHCs异常,从而使纯合子最终表现为耳聋,而杂合子小鼠听力正常[4]。Klhl18lowf纯合小鼠的突变无法采用现有的碱基编辑器来进行修复。虽然采用基于CRISPR/Cas9编辑器介导的同源修复(HR),可以实现任意碱基的改变以及DNA片段的插入或删除[5],但是HR修复方式主要发生在分裂的细胞,在活体动物组织中修复效率通常很低[6]。因此,研究者采用2017年报道的同源介导末端连接(HMEJ)这一修复方式[7],来提高体内正确基因编辑的效率(图二)。

技术分享:基因治疗小鼠常染色体隐性耳聋模型(图2)

图二 HMEJ介导修复方式[7]

研究者在体外细胞测试sgRNA编辑效率,选择效率最高的sgRNA用于体内基因治疗实验,并选择AAV9和AAV-PHP.eB进行基因递送。将SaCas9-KKH和sgRNA+donor分别装载在两个AAVs中,经检测发现双AAVs递送系统体外细胞测试的正确编辑效率高达17.8%,并且几乎没有脱靶(图三A)。在出生1天的Klhl18lowf纯合小鼠的内耳中注射双AAVs,14天后检测到整个耳蜗的基因组DNA成功编辑效率为0.1%,10周后可提高到0.32%(图三B)。相关研究表明Klhl18的缺失会导致IHCs变得尖细,但OHCs不受影响[4]。从扫描电镜图片观察到,基因治疗后8周龄小鼠的IHCs细胞形态与野生型相比恢复正常(图三C)。

技术分享:基因治疗小鼠常染色体隐性耳聋模型(图3)

图三 双AAVs递送CRISPR/Cas9-HMEJ修复的隐性耳聋小鼠基因治疗效果[3]

综上所述,利用AAV递送工具进行基因治疗,可在体修复部分常染色体隐性耳聋小鼠模型的单基因突变,恢复小鼠部分听力。不同基因编辑工具的DNA修复效率有所不同,可根据具体基因突变位点的属性来选择最佳修复工具。针对AAV载体容量受限问题,可将基因编辑工具拆分并利用双AAVs系统进行递送。尽管双AAVs递送会降低编辑效率,但在小鼠体内实验结果已经证明疗效明显。随着这些基因治疗系统的不断更新,未来还可拓宽应用到其他罕见病的研究以及转化治疗上。

参考文献

1. Carpena NT, Min YL: Genetic Hearing Loss and Gene Therapy. Genomics & Informatics 2018, 16(4):e20.

2. Yeh WH, Shubina-Oleinik O, Levy JM, Pan B, Liu DR: In vivo base editing restores sensory transduction and transiently improves auditory function in a mouse model of recessive deafness. Science translational medicine 2020, 12(546):eaay9101.

3. Gu X, Hu X, Wang D, Xu Z, Wang F, Li D, Li G-l, Yang H, Li H, Zuo E et al: Treatment of autosomal recessive hearing loss via in vivo CRISPR/Cas9-mediated optimized homology-directed repair in mice. Cell Research 2022,0:1-4.

4. Ingham NJ, Banafshe N, Panganiban CH, Crunden JL, Steel KP: Inner hair cell dysfunction in Klhl18 mutant mice leads to low frequency progressive hearing loss. PLoS ONE 2021, 16(10):e0258158.

5. Cox D, Platt RJ, Zhang F: Therapeutic genome editing: prospects and challenges. Nature Medicine 2015,21(2):121-131.

6. Yang Y, Wang L, Bell P, Mcmenamin D, He Z, White J, Yu H, Xu C, Morizono H, Musunuru K: A dual AAV system enables the Cas9-mediated correction of a metabolic liver disease in newborn mice. Nature Biotechnology 2016,34(3):334-338.

7. Yao X, Wang X, Hu X, Liu Z, Yang H: Homology-mediated end joining-based targeted integration using CRISPR/Cas9. Cell Research 2017, 27(6):801-814.